19/09/19

拉丁美洲地铁“最高抗菌素抗性”

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  • 科学家创建了地铁微生物的“地图集”来研究城市微生物生态系统
  • 研究发现,在拉丁美洲城市中,抗生素耐药性最为普遍。
  • 专家说,结果强调了更好地管理抗生素的需求

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对世界58个城市的城市运输系统和地铁进行的测试发现,拉丁美洲是抗菌耐药基因(RAM)的最高流行率的地区。

一支由600名研究人员组成的国际团队从栏杆,售票机和地下车站的墙壁上采集了3,741个样品,以创建一个城市微生物社区的“地图集”。

他们使用样品在那些城市的地方鉴定细菌,病毒和真菌(统称为微生物群),并分析遗传特征和抗生素耐药性的变化。

“这是一项前所未有的研究,由于技术进步,可以从大量数据中进行基因测序和计算分析,这是可能的,”

布宜诺斯艾利斯Leloir Institute Foundation科学家Cristina Marino Buslje

科学家确定了4,424种已知物种,其中70%以上的样品中发现了1,145种。在超过95%的样品中发现了61个,并且不是皮肤和气道的正常人类微生物群的一部分,也不是土壤的一部分。

该研究由非洲,美国,亚洲,欧洲和大洋洲的科学家联盟发表在生物xiv, 一个开放式预印库存储库,允许科学家立即将其发现提供给科学界

Eduardo Castro-Nallar, co-author of the paper and a researcher at Andrés Bello University’s Centre for Bioinformatics and Integrative Biology, in Santiago, Chile, said: “This led us to think that cities are an ecosystem by themselves, with a stable community of microorganisms.”.

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智利圣地亚哥的地铁。


此外,研究发现,无法鉴定出超过50%的收集的遗传样本,因此存在科学不知道或定义的微生物。

在拉丁美洲,科学家从Sao Paulo,Rio de Janeiro,Bogotá和Santiago的Subways和Urban Transport Systems取样。发现RAM基因的流行率比其他地区的城市高10到20倍。例如,里约热内卢和波哥大的公羊基因比巴黎,巴尔的摩或新加坡高出十倍。

该研究还表明,RAM的性质和基因的分布因城市而异。卡斯特罗·纳拉(Castro-Nallar)说:“尽管许多城市都存在许多微生物,但有一种微生物签名来识别每个城市:一个人可以采用样本,分析并预测其起源。”生物学研究所。

他说:“有些样本只有几个RAM基因,但其他样本有很多,这不仅在我们了解城市发展,而且在城市规划方面都有后果。”

这位科学家说,这表明需要更好地管理拉丁美洲的抗生素,并补充说:“我们论文的结果表明,RAM基因的流行率很高,只超过了尼日利亚的Offa。”

Cristina Marino Buslje, a scientist at the Leloir Institute Foundation’s Structural Bioinformatics Unit, in Buenos Aires, who did not participate in the study, said: “This is an unprecedented study, which was possible thanks to technological advances that allow gene sequencing and computational analysis from a huge amount of data.

“我希望这项全球研究中产生的数据将由政府官员在卫生政策中的决策中考虑。它还可以帮助卫生专业人员诊断和治疗感染。”

布宜诺斯艾利斯省国家西北大学的弗吉尼亚·帕斯奎内利(Virginia Pasquinelli)说:“这项工作不仅为城市微生物组分析提供了新的信息,而且还提供了免费的工具。最终目标是构建一个可以访问整个科学界的数据库,以允许在不同环境中复制和验证信息,从而为公共卫生带来利益。beplay足球体育的微博

“如今,我们知道微生物组可以调节我们的免疫系统反应;即使我们对肿瘤的反应也受到正常菌群的多样性的调节。认为与另一个城市微生物组之间存在互动是进一步调查的另一个好点。”

这篇文章由Scidev.net的拉丁美洲和加勒比海桌制作,并为清晰和简洁而编辑。