02/03/21

疟疾数据开放以打击抗药性

疟疾显微镜
疟疾显微镜技术人员培训课程。据世卫组织称,疟疾仍然是一个主要的全球健康问题,2019年估计有2.29亿例病例和409,000例死亡。版权:理查德·尼伯格(Richard Nyberg/USAID),,,,(CC BY-NC 2.0)

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  • 科学家策划了7,000个疟疾寄生虫的遗传变异数据
  • 已经为没有遗传学背景的人做出了“分析”
  • 专家说,该资源将极大地帮助耐药监视

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大量的汇总数据疟疾专家说,来自世界各地的寄生虫正在解锁该生物体进化的遗传秘密,并可以协助与耐药性进行持续的斗争。

科学家分析了来自28个国家的7,000粒恶性疟原虫疟原虫的遗传变异,并策划了数据,以使其可访问其他研究人员,包括那些没有遗传学专业知识的研究人员。

开放访问数据集在一项研究中进行了分析,该研究目前正在期刊上进行同行评审惠康开放研究,,,,代表世界上最大的资源基因组据英国剑桥的惠康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)称,有关疟疾寄生虫进化和耐药性的数据。

“随着我们继续对疟疾寄生虫之间的变化有助于疫苗功效的贡献,我认为这将是确保疫苗开发以更快的速度进行的真正有价值的资源。”

哈佛T.H.助理教授Daniel Neafsey陈公共卫生学院

理查德·皮尔森(Richard Pearson),合着者,数据惠康桑格学院的科学家告诉scidev.net数据可以帮助寻找新药和疫苗,以及控制和消除疟疾所需的监视工具的开发。

根据世界卫生组织(WHO WHO)的数据,疟原虫是通过蚊虫叮咬传播给人们的,是全球最致命的疟疾寄生虫,也是非洲最普遍的物种,根据世界卫生组织(WHO)(WHO)的数据,2018年,它在2018年占了近100%的疟疾病例。估计。

疟疾是可以预防的,可以治愈的,但仍然是一个主要的全球健康问题,2019年估计有2.29亿例和409,000例死亡。WHO

非洲地区受到不成比例的影响,占2019年疟疾病例和死亡的94%,尽管东南亚,东地中海,西太平洋和美洲的人们也处于危险之中。

疟疾数据Infogrpahic

寄生虫对抗疟疾的抗性药物自1950年代以来一直是一个经常出现的问题。同样是牛津大学大数据研究所的皮尔森(Pearson)表示,精选的数据可以帮助建立对这种抵抗遗传学的理解。

他说:“例如,疟疾的寄生虫不断发展,以使它们能够抵抗治疗疟疾的不同药物。”“了解哪些基因正在发生变化,这在世界上发生的地方可以帮助控制程序。”

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皮尔森说,寄生虫的其他遗传变化可能导致诊断测试的失败,导致患者未接受正确的治疗。

他补充说:“我们正在与寄生虫进行一场持续的军备竞赛。”“我们尝试新事物,新药等等,但是寄生虫与一生一样,都在不断发展,以寻找环绕它们的方法。我们正在努力保持领先地位。”

该数据是由疟疾人疟疾(一个全球群体网络)产生的,他们在共同建立旨在控制疾病的数据资源的同时,领导对疟疾生物学和流行病学的单独研究。

Researchers conducting 49 studies at 73 locations in Africa, Asia, South America and Oceania together contributed 7,113 samples of P. falciparum for the aggregated analysis and scientists at the Wellcome Sanger Institute sequenced each sample, looking at more than three million changes in the parasite’s DNA.

“Going forwards, as the dataset grows, the longer-term goal is to help inform the decision making of national malaria control programmes, to enable them to answer questions like, ‘Which drugs should we be using in which places?’ based on near real-time, high-quality data.”

根据世界卫生组织的说法,迫切需要更强大的疟疾监测系统来解决流行地区的疾病。

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哈佛T.H.免疫学和传染病助理教授Daniel Neafsey。美国公共卫生学院告诉scidev.net:“该数据集是世界上最新,最大的疟原虫疟原虫寄生虫基因组数据的结构。

“很多价值都来自分析数据的一致,同质和非常高质量的方式。例如,这确实可以帮助您筛选出不同突变的重要性,以表明耐药性对持续的抗药性监测。

“随着我们继续对疟疾寄生虫之间的变化有助于疫苗功效的贡献,我认为这将是确保疫苗开发以更快的速度进行的真正有价值的资源。”